Первыми владельцами этих мест были богатые сурожские купцы Сафарины. В 1631-1633 годах здесь уже было село Сафарино. Со временем название трансформировалось в Софрино, а владельцами его стали Салтыковы. Последняя владелица, Варвара Николаевна Ягужинская, завещала после своей смерти эти земли крестьянам.
Софрино много раз посещали цари и царицы по пути в Троицкий монастырь. Возможно, помня о славном прошлом этих мест, строить здание железнодорожного вокзала пригласили знаменитого архитектора А.В. Щусева.
В 1949 году в Софрино начали работу мастерские по производству церковной утвари. В 1980 – на их месте появился завод церковной утвари.